論文提要
本論文共分為八章：
第一章 緒論
首先，敘述論文寫作的研究動機，交待個人所使用《裨海紀遊》的版本，是根據民國四十八年（1959）四月由臺灣銀行經濟研究室所刊行本。其次，有關研究方法部分，除以《裨海紀遊》此書作為立論依據，在寫作上則秉持陳述和解析兩項主軸進行。在文獻探討上，則分為《裨海紀遊》之前和其同時的資料，以及目前和《裨海紀遊》相關的研究成果三個部分來說明。
第二章 清初台灣社會結構變遷
康熙二十二年（1683）清政府統治台灣的開始，台灣這塊土地在經歷荷蘭、西班牙、鄭氏等外來政權統治之後，取而代之的是清政府治理，在清初的整個台灣社會可以說是由官方、新移民、平埔族三部分所組成，而本章所論述有關台灣社會結構變遷，即是以這三個組成部分加以分析，將有助益於了解郁氏於清政府統治台灣十餘年（1683-1697）後，他所呈現出當時的台灣社會真實狀況和對統治制度提出的質疑。
第三章 《裨海紀遊》對台灣自然環境陳述之解析
《裨海紀遊》的內容乃客觀記載康熙三十六年（1697）台灣自然環境，這片仍未被完全開闢的土地，以及伴隨而來，反應當時人對大自然的觀察和理解，本章即針對郁氏陳述加以整理條列，而其在當時科學知識不足的限制下，所記載內容難免不盡詳細或有錯誤，則以今日之角度予以解釋辨析和補充。
第四章 《裨海紀遊》對清廷統治制度陳述之解析
郁氏來台距離清政府治台僅十餘年（1683-1697），由於郁氏親身經歷了解，可以更加真切記述地清初治台的成效和缺失，同時針對清政府治台的心態和措施，在《裨海紀遊》中也彰顯了郁氏的觀點，因此，將有助於認識郁氏個人的立場和想法。
第五章 《裨海紀遊》對平埔族物質文化陳述之解析
面對台灣日漸消失的平埔族群，具體文物的保留，格外深具意義，這是平埔族曾經存在的歷史痕跡，也不斷提醒族群消失的可能和可悲，因此，企圖建構平埔族們原始的社會生活時，藉由認識此一族群的食、衣、住、行，乃至娛樂的工具，是一個重要必備的基礎。
第六章 《裨海紀遊》對平埔族精神文化陳述之解析
台灣平埔族在未納入父系社會的價值體系之前，以母系為主是其社會生活、社會地位的考量，尤其是在婚姻制度和財產承繼制度方面。另外，在平埔族社會中的人們，有文身、肚等等，以毀損身體而達到裝飾自身的習俗，也形成一種特殊的文化，值得去探究其背後可能存在的精神意義。而在像平埔族原始社會最高層的精神展現為其信仰，相當不同於熟悉的佛、道教或西方的天主教、基督教，原始信仰和大自然的關係則相對顯得特別密切，處處可見超自然力量融合在平埔族生活點滴。
第七章 有關《裨海紀遊》的文學意義及其發展
《裨海紀遊》作為一本遊記文學亦有其價值地位，而在探討《裨海紀遊》文學意義上，對於郁氏的敘述手法及思維應先有所認識。除此之外，郁氏在詩和竹枝詞的創作，正是傳統古典文學薰陶和台灣特殊自然人文環境的激盪，也常引發學者對其創作雅俗二分的爭論。關於《裨海紀遊》的文學發展，則以個人所見以《裨海紀遊》為原型而進行的再創作，將以西川滿、葉石濤、顏金良、報導文學四個部分，來說明《裨海紀遊》一書在文學後續所產生的餘波影響。
第八章 結論─《裨海紀遊》的價值及其時代意義
從台灣這三百年來在自然與人文環境上的變遷，來突顯《裨海紀遊》一書的時代意義和價值。並對於像《裨海紀遊》之類的台灣古典文獻資料，不管是加以保存或是研究，予以肯定。

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