九七後的香港政治制度發展，不僅是香港學者所關心議題，也是台灣學者積極研究的對象。在「一國兩制」原則下，香港不得不接受這個框架，在此一制度下摸索並發展出其運作模式，由於香港特別行政區是行政主導體制，行政長官掌握絕對優勢，立法會無論在地位與職權上被實質矮化，其功能的發揮勢必無法如一般民主國家的議會政治，遑論有執政機會，因為在基本法的設計中，北京當局並不允許政黨有執政可能，行政長官產生有它獨特方式，其利用「小圈子」的間接選舉產生一個不具民意基礎的行政長官，既無民意基礎，在施政成效上自然大打折扣，行政與立法關係因此會陷入失衡狀態。
香港特區政府有關行政與立法兩權運作，始終面臨行政長官獨大局面，而立法會議員由於是以多管道方式產生，分別包括分區直選、功能組別及選舉委員會等三種方式，導致親中派議員佔大多數，由分區直選方式產生的所謂真正具有民意基礎的民主派議員無法掌握立法會的大多數席次，儘管如此，民主派議員在立法會中仍希望發揮實質監督政府運作角色，並藉由與民意結合發揮政黨影響力，從一九九八年假期條例草案、公務員改革、無證兒童案、胡仙案、區議會條例草案、主要官員問責制、細價股、梁錦松買車、基本法第二十三條等事件，都可以看出民主派積極爭取政黨運作空間及其與行政長官互動的斧鑿痕跡。
對立法會民主派來說，民意的支持是很重要因素，如果行政長官施政策略得當，進而贏得香港民眾信賴，民主派就無法結合民意造成行政長官壓力，但行政長官從回歸後就沒有辦法建立有效的施政同盟，其施政策略上的種種疏失，屢屢被香港民眾及輿論所批評，民主派議員因此結合民意、輿論力量，讓它的支持度始終維持一定水準，在基本法第二十三條立法過程中，香港民眾超過五十萬人走上街頭，則是一個成功的例子。
「一國兩制」的中心是「港人治港，高度自治」，立法會民主派始終追求此一目標，希望能在「一國兩制」框架下讓香港得到高度自治，其終極目標希望行政長官與立法會都能經由普選產生，即使政黨無法執政，但最起碼希望行政長官是真正由香港民眾普選所產生，真正代表香港民意，迄今的行政長官董建華雖獲連任，但其民意調查的支持度始終無法攀升，沒有民意基礎及無法貼近民意導致施政失當是其中的主要原因，在施政策略方面從上述諸多個案中不乏出現損害香港自治權情形。
本論文共分成七章：
第一章：說明本文的研究動機、目的；研究途徑、方法與架構；研究範圍與限制；資料與文獻分析等。
第二章：闡述香港與「一國兩制」政策，除先分別論述「一國兩制」政策的形成背景、發展過程及其目的，再論及「一國兩制」政策的實踐，亦即包括香港特別行政區基本法的起草與制定過程。
第三章：論述香港行政權變遷、規範與職權，從港英時代的政治制度規範到回歸後香港特區的政治制度架構設計及其運作情形。
第四章：論述立法權變遷、規範與職權，從港英時代的立法局到回歸後香港特區的立法會設計及其運作情形。
第五章：論述香港特別行政區1998年～2002年的行政與立法互動關係，從董建華的施政策略、強勢的行政主導及立法會民主派的挑戰等三層面進行探討，繼而論述包括經濟發展至上的保守主義、八萬五房屋政策、公務員改革、一九九八年假期條例修訂草案、法輪功事件、言論自由、胡仙案、無證兒童案、區議會條例草案等諸多個案中探討行政與立法互動，另再從學者精英實地訪談中強化本文的論證。
第六章：論述香港特別行政區2002年 ～ 2004年的行政與立法關係，從主要官員問責制、基本法第二十三條立法、人大釋法等三層面進行探討，繼而論述包括細價股事件、梁錦松買車事件、SARS（嚴重急性呼吸道症候群）事件、二十三條立法、人大釋法過程中探討行政與立法互動，另再從學者精英實地訪談中強化本文的論證。
第七章：結論。本文嘗試從回歸前後香港行政權與立法權演變過程，了解其中的組織運作架構，再從中分析回歸後的行政與立法關係，了解北京當局在香港特區行政與立法互動關係中所扮演角色，是否符合基本法中「港人治港，高度自治」原則。

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劉淑惠，「行政權與立法權的合理互動關係」，國家政策(動態分析)雙週刊，台北：第85卷，1996年，頁28-31。
劉慧卿，「香港政制民主的總結──可恥的過去，可哀的現在，可幸還有未來」，爭鳴，香港：總249號，1998年，頁33-36。
藍薔薇，「立法會選舉下看香港政局」，爭鳴月刊，香港：第275期，2000年，頁69-74。
藍薔薇，「梁錦松的背景值得注意 ── 加速走向『一國一制』的董建華時代提前到來」，爭鳴月刊，香港：總281期，2001年，頁60-61。
羅峰，「『居港權問題』全港通輸」，經濟一週，香港：總第916期，1999年，頁14。
（六）學術論文
邱垂正，過渡期中共對香港主權轉移之運作模式分析，台灣大學三民主義研究所碩士論文，1999年。
邱漢誠，中共「一國兩制」理論模式之解析與批判，政治作戰學校政治研究所，
招志強，探討一九九七後香港政治與經濟的改變，南華大學亞洲太平洋研究所，2002年。
施逸銘，中共對港政策之研究：1997～2000，政治大學政治學研究所，2001年。
郭瑞華，論中共「一國兩制」的理論與實際，中國文化大學大陸問題研究所，1988年。
郭俊麟，「一國兩制」在香港之法理、規範與實踐 : 1997-2000 ，南華大學亞洲太平洋研究所，2000年。
陳德正，港、澳基本法之比較研究，政治大學中山人文社會科學研究所，2000年。
張守一，一國兩制與一個兩區的比較與研究，政治大學東亞研究所，1996年。
張慧瑾，中共香港政策之研究 :「一國兩制」之分析，台灣大學政治學研究所國際關係組，1997年。
康鳳，對中共「一國兩制」理論及其實踐之研究，淡江大學中國大陸研究所碩士在職專班，2002年。
黃舒平，從香港民主化看中共「一國兩制」政策，淡江大學國際事務與戰略研究所，1996年。
劉濂，中共「一國兩制」之研究，中央警官學校警政研究所，1987年。
劉慶元，中共「一國兩制」的政治戰略研究，淡江大學國際事務與戰略研究所，1994年。
魏嘉吟，九七之後香港政黨與政團的發展：九八年與兩千年立法會選舉的比較分析，台灣大學國家發展研究所碩士論文，2001年。
蕭文芳，「一國兩制」下的「中」港關係（1997.7-2002.6），台灣大學國家發展研究所，2003年。
（七）媒體
中央通訊社（台北）
中央日報（台北）
中國時報（台北）
文匯報（香港）
自由時報（台北）
信報財經新聞（香港）
明 報（香港）
蘋果日報（香港）
聯合報（台北）
（八）網站資料
一國兩制研究中心（http://www.octs.org.hk/）
一國兩制論壇（http://galileo.spaceports.com/~k852c/）
香港大學民意調查網站 （http://hkupop.hku.hk）
香港社會科學網站（http://hk.geocities.com/socissue/）
香港特別行政區政府資訊中心 （http://www.info.gov.hk）
二、 英文部分
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Ghai ,Yash, Hong Kong's New Constitutional Order: the Resumption of Chinese
Sovereignty and the Basic Law(HK: Hong Kong University press,2001).
Ho, Pui-yin, The Administrative History of the Hong Kong Government Agencies
1841-2002(HK: Hong Kong University Press,2004).
Kuan ,Hsin-chi, Siu-kai Lau and Timmothy Ka-ying Wong,Out of the Shadow of
1997? (HK:the Chinese University of Hong Kong press,2002).
Lau ,Siu-kai,Social Development and Political Change in Hong Kong(HK:the
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Loh ,Christine , Building Democracy: Creating Good Government for Hong Kong,
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Tsang,Steve,A Documentary History of HK: Government and Politics (HK:Hong
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