鰈形目（PLEURONECTIFORMES）包含鰜科（Psettodidae）、棘鮃科（Citharidae）、鮃科（Bothidae）、無臂鮃科（Achiropsettidae）、菱鮃科（Scophthalmidae舊稱圓鮃）、牙鮃科（Paralichthyidae）、鰈科（Pleuronectidae）、冠鰈科（Samaridae）、鰨科（Soleidae）、無臂鰨科（Achiridae）、舌鰨科（Cynoglossidae）（Nelson，1994），依據先前之骨學與形態學資料，對於各科發生順序看法不一，且亞科與科的分類也存有爭議。此外，仍無法確知其起源為鱸形目中之哪一科，亦無法確知是否為單系群。本研究以粒線體之16S核糖體RNA的序列，針對[Stem+Loop]與[Stem]區段分別分析所構築之Minimun Evolution、Maximum Parsimony 親緣關係樹圖皆呈現一致性，鰈形目最近緣的類群應為鱸形目的鰺科魚類（Carangidae），且鰺科魚類使鰈形目魚類呈現並系群之狀態。依據本研究結果，冠鰈科、牙鮃科與無臂鰨科將應可獨立為一科，另外，對於鰈形目之棘鮃科、菱鮃科、無臂鰨科、鮃科、冠鰈科的發生順序也提出新的看法。

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