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| 研究生： |
葉昌憲 Chang-shang Yeh |
|---|---|
| 論文名稱： |
臺灣水鹿粒線體DNA序列之分析 Analysis of mitochondrial DNA sequences of formosan sambar |
| 指導教授： |
王穎
Wang, Ying 羅時成 Lo, Sze-Cheng |
| 學位類別： |
碩士 Master |
| 系所名稱： |
生命科學系 Department of Life Science |
| 畢業學年度： | 82 |
| 語文別： | 中文 |
| 中文關鍵詞： | 聚合.blksq.鏈鎖反應;種群發生;分子系統學;直接定序;分子時鐘 |
| 英文關鍵詞： | PCR;phylogeny;molecular systematics;direct sequencing; |
| 論文種類： | 學術論文 |
| 相關次數： | 點閱：208 下載：0 |
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臺灣水鹿(Cervus unicolor swinhoei)為臺灣之特有亞種生物;毛.blskq.
部分DNA萃取後,藉由PCR,直接定序(direct sequencing)方法,所得mtDNA序
列經排列比對得到806bps.在序列差異方面,臺灣水鹿與大陸水鹿在12S
rRNA 376bps部分完全相同,且與臺灣梅花鹿在16S rRNA 430bps部分也僅有
一個轉換(TV)二個轉變(TS)的差異存在.在16S rRNA中不同的鹿屬間,TS/TV
的值並無隨著序列差異的增加而降低,且和在相同的鹿屬內:水鹿與梅花鹿
TS/TV的值偏低的情形,不符一般TS的值在分化初期會隨時間增加而累積的
原則;而可能原因是,所選則的16S rRNA序列中有所謂的取樣偏差出現,造成
在分析時TS/TV的值降低,且影響到weighted parsimony用方法所做的種群
分析.所得的mtDNA序列中,經parsimony分析所得parsimony系統樹中,其一
致性雖不高,但與Miyamoto et al.(1990)的研究結果支持Groves & Grubb
(1987)利用側掌骨近端保留(plesiometacarpal condition of laternal
metacarpal)這項外在特徵,將羌屬和花鹿屬歸為鹿亞科的同一分歧樹
(clade)中.由演化距離中分析,鹿亞科在演化上出現的順序應為:山羌-->
梅花鹿-->水鹿;而由分子時鐘推測花鹿屬內的分化時間:水鹿與梅花鹿為
2-2.82百萬年前,而臺灣水鹿與另一亞種水鹿為0.66-0.93百萬年前;由臺
灣水鹿與大陸水鹿mtDNA 12S rRNA部分完全相同看來,它們可能於最近的冰
河期才開始分離.
