本文旨在探討台灣基督長老教會在台灣傳教過程所遭遇的問題，教會如何化解；以及長老教會如何從一個以英國宣教師為中心的教會，轉變成以本土信徒為中心的教會。因此本文主要由兩大主軸所構成，一是台灣本土教會的建立及傳教阻力與化解之道；一是本土教會的「三自運動」，也就是本土教會自養自傳自治的經過。
本文的主要重點在於：傳教主要對象的演變；初代信徒入信的原因；初代信徒的分析；傳教的阻力及其化解；英國宣教會完全支配的教會，如何走向由本地信徒自已承擔傳教費用，本地信徒負擔起傳教的責任，本地信徒自己管理教會。

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